若孕婦曾經流產、胎死腹中、超聲波檢查發現胎兒有異常或者在唐氏綜合症篩查中呈陽性，醫生都會建議接受入侵性產前檢查，診斷胎兒是否患有嚴重先天疾病。香港中文大學醫學院婦產科學系剛引入全基因組測序技術，比傳統方法更精確找出基因組微缺失或微重複，提升診斷靈敏度和準確性，研究結果已於國際期刊《Genetics in Medicine》發表。
(左起) 董梓瑞、梁德楊及蔡光偉表示FetalSeq胎兒測序可提供更精準的遺傳訊息。
中大醫學院婦產科學系系主任梁德楊教授提出，先天疾病有很多種，部分是由於染色體問題，如唐氏綜合症即是21號染色體多了一條而形成；而部分則是基因組出現微缺失或微重複(拷貝數變異)致病，可引致中度至嚴重智障、心臟或腦部等結構異常等，而這類遺傳病出現的機率約有1/1000。
低深度高通量方式檢測
針對微缺失或微重複基因問題，傳統上使用染色體微陣列分析(基因芯片技術)作診斷，今年醫管局更開始向高危孕婦提供免費檢測服務。但由於分析敏感度的限制，對於微缺失或微重複較細小的變異未必能夠偵測出來，另外則是只有少部分細胞出現基因異常的「低比例嵌合體」，也未必找得到。
中大醫學院婦產科學系副教授蔡光偉教授指出，「全基因組測序技術就可找出所有異常問題，但由於資訊量相當大，而且或有其他未必會致病的變異擾亂醫生診斷，故我們採用低深度高通量的方式作檢測(命名為FetalSeq胎兒測序)，除可降低成本外，亦可比傳統方法提升一倍靈敏度，若屬純合或半合子缺失更可有9倍靈敏度。」
將DNA樣本和試劑結合後，就放入自動化文庫建構機器中處理。
將處理完成的文庫注入芯片。
然後作全基因組測序及數據分析，最後輸出臨床報告。
提升確診率
為比較基因芯片技術及FetalSeq胎兒測序的準確性和有效性，中大團隊於2016至2019年完成了共1,023個入侵性產前基因檢測，作對比研究。中大醫學院婦產科學系研究助理教授董梓瑞博士表示，「研究結果發現，基因芯片技術確診了121個問題胎兒，而FetalSeq胎兒測序則確診了138個問題胎兒。最重要是FetalSeq胎兒測序可完成所有基因芯片技術找出的異常，而且失敗率只有0.5%，減少孕婦重複抽取羊水或絨毛的風險。」
助家庭檢視生育計劃
研究中其中一個個案，發現胎兒頸部透明層增厚，疑有先天性異常，但基因芯片未能找出問題，而FetalSeq胎兒測序就發現了半合子缺失，將引致杜興氏肌肉營養不良症，會因肌肉沒有足夠力量而要用輪椅代步。團隊再經過其他方法，驗證了基因缺失是來自母親。梁德楊指，「此技術能夠為孕婦及其家庭提供更準確的胎兒診斷，以助他們作出相應決定，並檢視日後的生育計劃。」