上文提到，晚間磨牙除了令牙齒受損外， 面部肌肉關節也可能因而僵硬及疼痛。而在處理磨牙問題上，比夠普遍的做法是度身訂製護牙套以供晚上佩戴，作用好像頭盔一樣，避免牙齒繼續磨蝕。如果磨牙牽涉到咀嚼肌不適或炎症，在正確診症後，醫生可能會使用肌肉鬆弛劑或消炎藥，以助減輕痛楚。當然，治標之外也要治本，假如磨牙是由於牙齒咬合不正而引起，那麼就要處理咬合問題；也有患者心理壓力過大，導致入睡後磨牙，通常他們正視情緒問題後，調整生活及工作模式，已能減少磨牙情況。
有不少患者因磨牙嚴重而影響牙齒健康，使牙齒負擔過重，如骨牌效應般逐隻地咬裂而要脫牙。在這些情況下我們可考慮全口重建評估及治療，以恢復穩定咬合。但如除此之外牙骹也感痛楚，甚至伴有頭痛、暈眩、頸痛及耳鳴等症狀，可能已出現了顳顎關節症候群(Temporomandibular Joint disorder, TMD)。此症成因是顳顎關節或咀嚼肌受損，如經一段時日症狀未有改善的話，就要介入牙科治療了。顳顎關節由咀嚼肌、關節盤、骨骼及韌帶組成，在進行療程前，牙醫必須診斷是哪個部分出了錯，才可對症下藥。若然病因是咀嚼肌太繃緊或發炎，誘發出牙骹痛及頭痛，牙醫便會考慮處方肌肉鬆弛藥物等治療，讓肌肉得以放鬆。一些保守性治療如激光及關節運動訓練，也有助改善血液循環，減輕疼痛。
如果問題由關節盤而來，症狀包括開口有「卡」聲、張口感到困難等，可進行關節穿刺術。其原理是先用生理鹽水沖走關節中混濁的發炎組織後，再注入透明質酸作為潤滑劑，讓關節恢復靈活及改善「卡」聲情況。情況就像木門因使用太久而不靈活，但噴了潤滑劑後，開關門時便可變回順滑。另一方面，假如症狀與顎骨接駁部位退化有關，情況嚴重時就有需要進行重建手術。但無論如何，一旦發現自己有顳顎關節症候群症狀，最好盡快向你的家庭牙醫求診，否則不單會被病情折磨，更可能因延醫而導致惡化。